Este modelo plantea que el Centromero ha evolucionado pero en un principio fue el primer Sistema Biológico de Transcripción Inversa que junto a una Telomerasa leía los ordenadores libres como ARN transformándolo en ADN mono catenario uniéndolos uno a uno para formar lo que fue en un inicio el esqueleto primario de los cromosomas.
A mi entender, la doble hélice (COMPLEMENTARIEDAD) fue un hallazgo evolutivo necesario que le permitió a la célula por un lado lograr la división de una cantidad de información genética cada vez más grande de manera relativamente fácil y eficaz y por el otro la posibilidad de poder diferenciar las células como lo veremos más adelante.
Cronológicamente hablando el modelo plantea que en la formación de los cromosomas se distinguen dos tiempos:
-primer tiempo: en este se incorporaron los ordenadores en sentido centromero-telomero.
-segundo tiempo: los ordenadores además del sentido centromero-telomero se incorporaron en sentido telomero-centromero y funcional mente estaban relacionados con la diferenciación celular. En este tiempo ya debió existir en el medio que circundaba los ordenadores ademas de enzimas con acción transcriptasa inversa y ADN polimerasa, enzimas de corte y empalme de ADN entre otras.
¿Porque 23 cromosomas somáticos y uno sexual?
Es posible que esto fue determinado espontáneamente como una forma de sector izar y poder hacer funcional los distintos programas de aplicación. Estos llegaban como ordenadores a través de los virus al CCER, estas al incorporarlos a los cromosomas utilizaban la SECUENCIA DE RECONOCIMIENTO DE PROCEDENCIA, y muy probablemente, varios cromosomas posibilitarían sector izar los ordenadores por procedencia facilitando el trabajo de creación del sistema operativo.
¿Cómo estaría organizado un ordenador ideal en nuestro modelo?
Un ORDENADOR entre su Bi y Bf al ser almacenado como ADN puede presentar dos zonas:
1-ZONA REGULATORIA: constituida por la secuencia A y secuencia B.
2-ZONA EJECUTORIA: constituida por la secuencia C y la secuencia D.
Bi/——A——-//—–B——/————–C——————-/—-D—-/Bf
Bi/——-zona regulatoria — /————-zona ejecutoria————–/Bf
A: secuencia de bases de RECONOCIMIENTO del ordenador.
B: secuencia de bases de activación del ordenador. Si B no existe el ordenador esta inhabilitado.
C: secuencias de bases de ejecución del ordenador. Esta secuencia codifica las ordenes que porta el ordenador. Solo serán ejecutadas si el ordenador es transcrito.
D: secuencia de bases de final del ordenador. Esta secuencia codifica el final de la transcripción del ordenador.
Ley genética: todos los ordenadores del ADN tienen en su otra hebra el ordenador complementario.
ORDENADOR BIOLÓGICO: ordenador mas ordenador complementario.
Analicemos las posibles secuencias en un ORDENADOR IDEAL:
ZONA REGULATORIA DE UN ORDENADOR:
A: es una secuencia finita de bases nitrogenadas que sirven de reconocimiento del ordenador por parte de otro ordenador.
Esta secuencia estaría dividida en:
A: /——-A1——/————A2———————–/
A1: secuencia de reconocimiento de especie.
A2: secuencia de reconocimiento de cluster.
Ley genética:
1- A jamas se transcribe.
2- No todos los ordenadores del genoma humano deben comenzar con A1. Pero si todos los ordenadores no ejecutables del CBM comienzan con A1.
3- Un cluster biológico esta formado por todos aquellos ordenadores que tienen igual A2.
4- dos ordenadores homólogos del CBM poseen igual A.
5- Cuando hablamos de zona de reconocimiento de un ordenador NO hablamos de CODONES ya que el numero de bases podría ser distinto de 3 y no necesariamente múltiplo de 3.
B: es una secuencia de bases de ACTIVACIÓN del ordenador.
– ORDENADOR INHABILITADO: no presenta la secuencia B
– ORDENADOR ACTIVO: presenta la secuencia B.
Ley genética: que el ordenador este activo no significa que sera transcrito. Para que ello ocurra la secuencia de B deberá estar expuesta a la red química al sistema biológico transcripcional.
En nuestro modelo la Zona Regulatoria tendrá dos COMANDOS:
COMANDO INTELIGENTE: dado por la secuencia A1-A2. Sirve de reconocimiento del ordenador por parte de otro ordenador.
COMANDO TRANSCRIPCIONAL: dado por la secuencia B. Esta secuencia al estar expuesta a la red química es reconocida por los factores de transcripción.
ZONA EJECUTORIA DEL ORDENADOR:
/———-B——–//————————————C————————/–D—Bf
B: en la secuencia de bases B se encuentra el PROMOTOR que al estar expuesto a la red química permite que los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN sean activados generándose una secuencia de múltiples ensambles entre ellos, al finalizar, queda todo listo para que la ARN polimerasa ingrese, reconozca una secuencia de bases y comience la transcripción.
En nuestro modelo llamaremos SISTEMA BIOLÓGICO TRANSCRIPCIONAL (SBT) a los FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN (FT) + ARN POLIMERASA (ARNp).
C: es una secuencia finita de bases nitrogenadas del ordenador que al ser transcrita por las ARNp y volcado el producto de transcripción ARNm inmaduro a la red química hace que se genere una orden.
El ARNm inmaduro en la red química sufrirá un proceso de maduración a través del Mecanismo Genético de Splicing produciéndose una o mas moléculas de ARNm funcional el cual se encargara de ejecutar la orden.
D: es una secuencia finita de bases que produce la finalizacion de la transcripción. La secuencia de D tendrá, entre otros, uno de estos tres codones ATT, ATC o ACT. Cualquiera de estos sera reconocido por el ARNt para detener la síntesis proteica
La secuencia de bases C puede presentar dos zonas:
//————————-E——————–/———————-G——————-/
1-E: zona NO GEN
Esta zona podría estar formada por dos secuencias distintas:
E1: secuencia finita de bases que serviría para reconocer ordenadores. ARNi de reconocimiento.
E2: secuencia finita de bases que al ser transcrito por la ARNp generaría un ARNm que post Splicing podría actuar sobre una secuencia anterior al Promotor de otro ordenador activando o frenando la transcripción. ARNi regulación de transcripción.
2-G: zona GEN
/-Go-/——-Ge———–/——-Gi——-/—–Ge——-/——-Gi——-/—-Ge——–/
Go: codon que reconoce el ARNt para comenzar la síntesis proteica- Secuencia TAC.
Ge: secuencia de codones que codifican la cadena polipeptidica. Serian los Exones.
Gi: secuencia de base nitrogenadas que forman los Intrones. Estos no codifican cadena polipeptidica.
La zona G estaría formada por una secuencia de exones e intrones
/-Go-/exones-intrones-exones-intrones–/—-Gv—-/Go-/exones-intrones-exones-/
/-Go-/—————————G1———–/—-Gv—-/Go-/——–G2—————–/
Gv: secuencia de bases que es tomada por la ARNp como una zona vinculante, no deteniendo la transcripción. En este caso el ARNm inmaduro tendrá el gen G1 y el gen G2.
Un ordenador podría tener en la zona gen varias secuencias vinculantes.
¿Qué es en nuestro modelo un Clúster Biológico?
Cluster biológico: es un conjunto finito de múltiples ordenadores con igual A2 unidos por una red química de alta velocidad de forma tal que el conjunto es visto como un único ordenador.
Cada Cluster Biológico contiene las ordenes necesarias para manifestar una función o hecho especifico y puntual.
Cada Cluster Biológico puede recibir o generar ordenes.
Puede recibir ordenes de Activación o Inhabilitacion de los ordenadores.
Puede generar ordenes de activación o inhabilitacion de ordenadores o generar síntesis de proteínas.
Clasificación de los Cluster Biológicos:
1- CLUSTER BIOLÓGICOS NO EJECUTABLES: cuando son transcritos la orden genera solo efecto a nivel de ordenadores.
¿Como fueron concebidos?
Estos cluster fueron concebidos en el CCER y probados y re adaptados para ser funcionales en la Célula Reproductora.
Estos Cluster van surgiendo a medida que van llegando al CCER los virus conteniendo los ordenadores que van surgiendo de los distintos Programas de Aplicación creados por los distintos clones celulares que se van diferenciando dentro del CCES.
Los ordenadores que portan los virus deberían tener en primera instancia dos zonas bien diferenciadas en su secuencia:
Supongamos ahora un virus que porta un ordenador cualquiera:
– Una zona debería indicarle al CCER la procedencia del ordenador, es decir, a través de esta secuencia el CCER podría reconocer y agrupar en bloques, en un área de un cromosoma, la información genética recibida de un clon X de células del CCES en proceso de diferenciación.
– Y otra zona que contenga la secuencia del GEN creado por el clon celular X en un momento X de la MP.
¿ Como procedería el CCER en la creación del ordenador no ejecutable?
El CCER deberá trabajar en dos situaciones distintas:
– una re adaptando el ordenador recibido a través del virus para luego empaquetar-lo en la molécula de ADN bicatenario en formación como un ordenador inhabilitado ejecutable, es decir la proteína que codifica generara efecto a nivel de operatividad celular de diferenciación.
- crear el ordenador no ejecutable para que este de algún modo active el ordenador anterior en una nueva secuencia iniciada por la CR el momento exacto donde fue creado por la MP que informo vía virus al CCER.
¿Como quedarían ambos ordenadores en una primera instancia?
- Ordenador del virus:
/—secuencia de procedencia o linea–()–secuencia no gen–/–secuencia gen-/
(): secuencia de bases corta que permite reconocer la zona ejecutoria del ordenador transportado por el virus.
- Ordenador ejecutable:
/–secuencia de fase–/–secuencia de procedencia o linea—-//– secuencia no gen–/–secuencia gen-/
/—————zona regulatoria A3——————————//—zona ejecutoria————————-/
El modelo plantea que la secuencia de fase es creada por el CCER ya que este tendría la información genética actualizada total recibida hasta ahora de la linea por lo cual le seria mas fácil determinar a través de esa secuencia el momento exacto en que el ordenador ejecutable debería ser activado cuando la célula reproductora inicie una nueva secuencia.
- Ordenador no ejecutable creado:
/—A1—/——A2—————-//————–A3———————/
A2: secuencia de bases que deberá reconocer el ordenador no ejecutable anterior para así activar el ordenador no ejecutable creado colocando la secuencia B en el punto //.
A3: secuencia de bases que al ser transcrita generara un ARNi que posibilitara la activación del ordenador ejecutable anterior.
Pero hasta ahora hablamos de un ordenador.
En una Fase es muy posible que sean varios los virus que lleguen al CCER perteneciendo a distintas lineas por lo cual es muy probable que se creen varios ordenadores no ejecutables que tendrán igual A2, pero que diferirán en A3.
Este grupo de ordenadores no ejecutables con igual A2 definen un CLUSTER BIOLÓGICO NO EJECUTABLE. Este Cluster biológico No Ejecutable, en una nueva secuencia de vida, definirá en el momento justo una FASE en cada linea donde este.
Esta creación realizada por el CCER sera probada por la célula reproductora una vez que sea eliminada he inicie una nueva secuencia. Probando se hará funcional la creación y si es necesario la célula reproductora re adaptara el o los ordenadores que generen un conflicto.
¿Como queda formado un ordenador no ejecutable?
/—-A1—-/—–A2———–//———A3———–/——-A4?————-/
/—–zona regulatoria——–//———–zona ejecutoria——————–/
/——————————-//—zona no gen E1—-/—zona gen ? G——/
Un ordenador no ejecutable siempre posee una zona regulatoria.
Todos los ordenadores no ejecutables comienzan con A1 (secuencia de especie).
Todo ordenador no ejecutable posee la zona ejecutoria no gen E1.
La zona E1 sirve de reconocimiento de otro ordenador que puede ser no ejecutable o ejecutable de diferenciación celular.
Un ordenador no ejecutable podría llegar a tener una zona gen G en la zona ejecutoria, pero la proteína que codifica solo actuaria a nivel de ordenadores ejerciendo algún tipo de regulación estimuladora o inhibitoria.
Un ordenador no ejecutable si no posee en el punto // la secuencia B el mismo esta in-habilitado.
Un ordenador no ejecutable si posee en el punto // la secuencia B el mismo esta activado. Un ordenador no ejecutable activado siempre esta expuesto al Sistema Biológico transcripcional que en este caso sera SBT etapa embriogenica.
Si varios ordenadores no ejecutables activos pertenecientes a un cluster solo reconocen con la zona E1 otros ordenadores no ejecutables a los cuales activan tras la división celular las dos células hijas no habrán variado su operatividad en relación a la célula madre.
Si varios ordenadores no ejecutables activos pertenecientes a un cluster ademas de reconocer con la zona E1 otros ordenadores no ejecutables reconoce y activa ordenadores ejecutables de diferenciación celular tras la división una o ambas células hijas habrán cambiado bruscamente su operatividad en relación a la célula madre.
Estos ordenadores ejecutables de diferenciación celular activos podrían tener efecto regulatorio sobre la transcripción de ciertos ordenadores no ejecutables activos.
Un ordenador no ejecutable podría tener en la zona ejecutoria no gen varias secuencias repetitivas E1 iguales separadas por una secuencia corta vinculante.
/—–A1—-/——–A2———–//——–A3—-/Av/—-A3—–/Av/—–A3—–/Av/—etc./
Esta situación podría haber sido utilizada por la evolución para asegurar en algún punto de la secuencia que la orden que portan por su importancia si o si se cumpla.
Definamos en nuestro modelo CLUSTER BIOLÓGICO MADRE:
CBM: conjunto finito de CLUSTER BIOLÓGICOS NO EJECUTABLES que son creados por el CCER y la CR con el fin de lograr un sistema operativo que tendrá las ordenes necesarias para generar una secuencia de hechos que posibiliten concretar la etapa: Programa de Aplicación Etapa embriogenica.
Ley genética: los cluster biológicos no ejecutables son activados o in-habilitados exclusivamente por cluster biológicos no ejecutables.
Cuando una célula adquirió en su genoma la totalidad del programa de aplicación que portara hasta el final de la vida es porque todos los cluster biológicos no ejecutables han sido in-habilitados.
Un ordenador no ejecutable solo podrá activar un ordenador ejecutable de diferenciación in-habilitado.
Nunca un ordenador no ejecutable podrá in-habilitar un ordenador ejecutable de diferenciación celular, una vez que los activa no se puede volver atrás.
2- CLUSTER BIOLÓGICOS EJECUTABLES: cuando la orden genera efecto a nivel celular. Las encargadas de generar cambios importantes en la operatividad funcional o metabólica de la célula son las PROTEÍNAS.
Se clasifican en:
2.1- ACTIVOS PERMANENTEMENTE: no necesitan del CBM para ser activados aunque si fuese necesario podrían ser in-habilitados por este en alguna situación particular.
Estos ordenadores tienen la particularidad de no generar diferenciación celular; son proteínas en común a todo tipo de célula diferenciada que puede generar el cigoto.
Es muy probable que muchos de estos ordenadores ejecutables activos permanentemente no estén organizados en cluster biológicos. Muchos ya estaban en la Célula Base.
Otros han ido apareciendo según necesidad durante el proceso evolutivo sumándose al camino genético.
Están agrupados en GRUPOS. Estos son muy precisos e independientes.
Cada grupo de ordenadores ejecutables activos permanentemente sufre uno de los dos procesos regulatorios:
– Auto regulación
– Regulación vía otros grupos.
En primera instancia podemos hablar de dos grandes grupos generales:
a- Grupo de ordenadores ejecutables activos permanentemente de soporte metabólico básico.
b- Grupo de ordenadores ejecutables estructurales activos permanentemente: son proteínas que intervienen en todo el sistema estructural de la células.
Algunos Grupos de ordenadores ejecutables activos permanentemente que nos interesan en nuestro modelo
– GRUPO ADN CÍCLICO MITOCONDRIAL.
– GRUPO DE ENZIMAS METABÓLICAS
– GRUPO SISTEMA BIOLÓGICO TRANSCRIPCIONAL (SBT)
– GRUPO DUPLICACIÓN ADN.
– GRUPO CITOCINESIS
– GRUPO LIMPIEZA Y DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS, ARN, ETC..
2.2- CLUSTER BIOLÓGICOS EJECUTABLES IN-HABILITADOS O DE DIFERENCIACIÓN CELULAR: necesitan del CBM para ser activados. Estos cluster contienen toda la información genética necesaria para transformar el Cigoto en todos los clones de células diferenciadas que conforman el ser humano.
Este proceso se realiza a través de una secuencia dirigida por el CBM.
Cada clon de células diferenciadas al final de la Etapa Embriogenica habrá adquirido un programa de aplicación que portara hasta el final de la vida.
Los distintos programas de Aplicación somáticos fueron concebidos en el CCES y el programa de aplicación sexual en el CCER. A su vez este ultimo centro seria el encargado de eliminar la célula reproductora.
Cada paso evolutivo seguramente tuvo millones de conflictos que no prosperaron, pero la insistencia y el azar de que el camino genético evolutivo no se corto dio sus frutos en la maravillosa concepción de la ESPECIE HUMANA.
Definamos en nuestro modelo el Sistema Biológico permanente
-El modelo plantea que el primer Sistema Biológico de Transcripción Inversa fue el centromero que junto a una TELOMERASA permitió transformar los genes en estado libre como ARN en ADN, empaquetándolos y dando inicio al esqueleto primario de los futuros cromosomas, ahora en crecimiento.
Esas hebras simples de ADN que se iban formando encontraron estabilidad uniéndose a pequeñas secuencias complementarias a través de los puentes de hidrógeno, pero este sistema paliativo tomo protagonismo cuando la evolución pudo sintetizar la primer ADN polimerasa.
Con esta encontró un sistema, la doble hélice, que le permitía acceder a la duplicación de una manera fácil y efectiva. La adición de desoxi-ribosa fosfato otorgaría la fuente de energía en ese proceso.
Hasta este tiempo los genes se incorporaban en sentido centromero-telomero.
El crecimiento en longitud de la doble hélice en ese sentido se iba haciendo inestable por lo cual la evolución debió buscar la forma de estabilizar la estructura, es ahí donde encuentra la manera, a través de la incorporación de las histonas y creación de los nucleosomas.
Ahora la secuencia de nucleosomas iba definiendo el esqueleto final de los brazos de los cromosomas en crecimiento.
La evolución debió ir colocando las histonas de una manera progresiva a medida que los ordenadores se incorporaban teniendo como objetivo que las mismas debían ser creadas de tal forma de hacer funcional el ordenador en cuestión.
Esta creación debía responder eficazmente a los Sistemas Biológicos de lectura que ya evolutiva mente iban apareciendo.
En definitiva, el brazo de un cromosoma terminaba siendo un cable proteico donde se enrollaba la secuencia de ordenadores biológicos unidos unos a otros constituyendo la doble hélice de ADN.
La creación y ubicación de las histonas debía generar puertas y ventanas en la doble hélice que le permitieran a los Sistemas Biológicos de lectura cumplir con sus funciones permitiendo además el accionar de un sistema de reconocimiento o regula torio de expresión de los ordenadores que también evolucionaban a la par.
Ese Sistema Regulatorio de expresión en gran parte fue posible gracias a que la evolución pudo articular la secuencia de nucleosomas de tal forma de llevarlo desde la compactación extrema hasta lo que conocemos como collar de cuentas.
En nuestro modelo a este sistema lo denominaremos:
SISTEMA BIOLÓGICO DE CROMATIZACION:
En su versión más evolucionada es el sistema encargado de introducir las histonas en la doble hélice post duplicación ADN, de esta manera produce la cromatina o secuencia de nucleosomas que constituyen los brazos de los cromosomas.
Este mecanismo genético es muy preciso y tras la duplicación del ADN responde a una serie de patrones de reconocimiento dado por los cuatro pares de histonas del nucleosoma madre que debe ser duplicado en dos nucleosomas hijos.
No debe fallar en la colocación de cada una de las histonas ya que esto podría traer aparejado una falla en la funcionalidad del ordenador.
Asimismo como veremos más adelante, en ciertas ocasiones podría tener que cambiar una histona por otra respondiendo a un cambio en el numero de bases nitrogenadas del ordenador.
Evolutiva mente hablando cada histona creada fue concebida a lo largo del tiempo a medida que fueron requeridas asegurando la funcionalidad del ordenador almacenado oportunamente como ADN.
Cada histona creada presenta un ordenador en el ADN que codifica su secuencia de amino-ácidos.
Seguramente estos ordenadores ejecutables activos permanentemente forman un grupo muy concreto. En el caso de que la célula este imposibilitada de dividirse la síntesis de estas servirán para algún posible recambio.
¿ Como estaría formado el nucleosoma?
Formado por un núcleo proteico de cuatro pares de histonas, (H2A, H2B, H3 y H4), ocho en total, formando una estructura espacial en la cual la doble hélice está anclada. Cada octámero de histona está rodeado por 1.7 vueltas aproximadamente de ADN bicatenario. Dos nucleosomas consecutivos están separados por una secuencia de ADN espaciador. Otra histona H1 se extiende sobre la molécula de ADN fuera de la parte central del nucleosoma. La histona H1 está relacionada con la condensación de la cromatina, sin embargo es también parte del SBN interviniendo activamente en las distintas cuestiones relacionadas a este. Al sistema se agregarían ciertas proteínas no histonas.
UN ORDENADOR BIOLÓGICO ESTARÍA ANCLADO SOBRE UNA SECUENCIA DE UNO O MAS OCTAMEROS DE HISTONAS DEPENDIENDO DE LA CANTIDAD DE BASES NITROGENADAS QUE TIENE LO QUE SE RELACIONA DIRECTAMENTE CON LA ORDEN QUE CODIFICA.
SISTEMA BIOLÓGICO NUCLEOSOMA (SBN): ordenador biológico + numero de nucleosomas sobre el cual apoya.
Porción de cable proteico sobre el cual se enrolla un ordenador biológico.
Definamos:
Cable proteico: secuencia de octameros de histona mas la histona H1.
En nuestro cable proteico definiremos el termino LUGAR como el sito donde se asienta la Zona Regulatoria de un Ordenador biológico.
A este sitio lo denominaremos LUGAR PRINCIPAL.
Definiremos como LUGAR SECUNDARIO a todos aquellos sitios del cable proteico que expuestos a moléculas orgánicas pueden sufrir reacciones químicas que modifiquen la situación espacial del mismo y por ende la exposición o no a la red química del LUGAR PRINCIPAL.
El LUGAR PRINCIPAL puede funcionar como COMANDO:
– COMANDO INTELIGENTE: cuando solo esta la secuencia de bases A. Al no estar la secuencia B el ordenador esta in-habilitado.
El comando inteligente es un lugar fundamental para lograr el reconocimiento de un ordenador por parte de otro ordenador y así ser activado.
– COMANDO TRANSCRIPCIONAL: una vez activado el ordenador por el respectivo mecanismo genético el comando inteligente se transforma ademas en comando transcripcional pues incorporo en la zona regulatoria la secuencia de B.
Formado por la secuencia B.
¿COMO SERIAN LOS ANCLAJES ENTRE LOS ORDENADORES BIOLÓGICOS Y LAS HISTONAS?
Independientemente de la secuencia de bases nitrogenadas de la doble hélice los anclajes mas comunes están dados por el grupo fosfato de la doble hélice y las histonas.
Sin embargo nuestro modelo plantea que ciertas secuencias de bases de los ordenadores biológicos generan con la histona un anclaje mas fuerte y organizado capaces de actuar como:
-RECEPTORES INTRANUCLEARES ADN-HISTONA. (RI=ADN-H)
Como se clasifican los RI=ADN-H:
1-PUERTAS: se definen como un RI=ADN-H que al estar expuesto a la red química permitiría que algún Sistema Biológico pueda reconocer y tras una secuencia de ensambles ingresar a la intimidad de la doble hélice.
A- PUERTAS DE ENTRADA:
A1- RI=ADN-H transcripcional.
Formado por la secuencia B de un ordenador mas la histona que llamaremos Histona B.
Función: este receptor al estar expuesto a la red química permite el accionar del SBT (factores de transcripción + ARNp) posibilitando la lectura de la zona ejecutoria del ordenador a través de la generación del correspondiente ARNm inmaduro.
A2- RI=ADN-H duplicación ADN.
Formado por la secuencia R ínter locus y las respectivas histonas.
Función: este receptor al estar expuesto a la red química posibilita que el Sistema Biológico Duplicación de ADN se active generando el replisoma y posterior duplicación del ADN.
A3- RI=ADN-H primario.
Formado por la secuencia regulatoria de un ordenador mas la histona correspondiente.
-RI=ADN-H primario A inteligente.
Formado por la secuencia A de un ordenador mas la histona que llamaremos A.
Función: este receptor permite el reconocimiento del ordenador por otro ordenador.
-RI=ADN-H primario AB doble.
Formado por el RI=ADN-H primario AB inteligente + RI=ADN-H primario AB transcripcional
RI=ADN-H primario AB inteligente
Formado por la secuencia A de un ordenador mas la histona que llamaremos AB
Función: este receptor permite el reconocimiento del ordenador por otro ordenador.
RI=ADN-H primario AB transcripcional.
Formado por la secuencia B de un ordenador mas la histona que llamaremos AB.
Función: este receptor permite la transcripción del ordenador por el SBT.
B- PUERTAS DE SALIDA:
B1- RI=ADN-H D salida transcripción.
B2- RI=ADN-H FR salida duplicación ADN.
2-VENTANAS: se definen como un RI=ADN-H que al estar expuestos a la red química se ensamblan a un sistema biológico pero este no puede acceder a la intimidad de la doble hélice.
- RI=ADN-H secundario.
Formado por una parte de la secuencia de los intrones y las histonas correspondiente.
Función: a medida que avanza la ARNp en la transcripción comienza a tener problemas con la ruta. El modelo plantea que en la transcripción no se usa una Topoisomerasa. Estos receptores intra-nucleares al acercarse la ARNp los expone a la red química lo que produce un ensamble con ciertos factores de transcripción que automáticamente re acondicionarían la ruta para que pueda proseguir.
-RI=ADN-H quiasma.
Formado por una secuencia interlocus mas las histonas correspondientes.
Función: posibilitar el apareamiento de las zonas combinantes de dos cromosomas homólogos.
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¿Como se produciría el RECONOCIMIENTO de un ordenador no ejecutable del CBM por otro ordenador no ejecutable?
¿ QUE ES EN NUESTRO MODELO AL ARN INTERFERENTE. ARNi ?
ARNi: es una secuencia de bases nitrogenadas (A-U-C-G) que resulta de la transcripción de la zona ejecutoria no gen de un ordenador no ejecutable.
En primera instancia, tras la transcripción, forma parte del ARNm inmaduro.
Este ARNm puede estar formado por una secuencia no gen solamente o por una secuencia no gen + la secuencia gen.
Este en la red química es sometido al mecanismo de Splicing donde es atacado por diversos sistemas biológicos.
Supongamos ahora un ordenador no ejecutable del CBM el cual se encuentra activado y presenta en su zona ejecutoria solo la secuencia no gen E1
Or1 /—A1—/—–A2—–//—-B—–/———-E1————/
E1= A3+A1
Entonces seria:
Or1 /—A1—/—–A2—–//—-B—-/——A3——-/—A1—/
La ARNp ingresa el el punto // y comienza la transcripción generando el ARNm inmaduro correspondiente.
ARNm: //—-Bc—-/———–A3c———/—A1c—/
Ley genética:
Si la secuencia de A1= AATCCC
Siempre el final de la secuencia de la zona ejecutoria no gen de un ordenador no ejecutable del CBM sera = CCCTAA
Or1 /AATCCC/——A2——//—-B—-/———A3———-/CCCTAA/
ARNm: //—-Bc—-/———A3c——–/GGGAUU/
Supongamos ahora la siguiente secuencia de B:
B= AAATAT
Or1 /AATCCC/—-A2——//AAATAT/———A3———-/CCCTAA/
ARNm //UUUAUA/———A3c———/GGGAUU/
En este caso al no existir zona gen el ARNm se convierte en ARNi
ARNi= /UUAGGG/———-A3c———/AUAUUU//
Esta secuencia se unirá en sus extremos a dos proteínas especificas en el mecanismo de Splicing generando el:
SISTEMA BIOLÓGICO ARNi:
SBARNi= PROTEÍNA A1/UUAGGG/——A3c—/AUAUUU//PROTEÍNA B
Supongamos ahora otro ordenador no ejecutable in-habilitado: Or2:
Or2 /—–zona regulatoria————//—-zona ejecutoria—————/
Or2 /AATCCC/——–A3———–//——–E2——-/———G2?—–/
Asignemos-le una secuencia arbitraria a A3
A3= /TTTCGCGCTATC/
Or2 /AATCCC / TTTCGCGCTATC //——–E2——-/—–G2?—-/ Reconocimiento /————————————–//
SBARNi= PA1-/UUAGGG /AAAGCGCGAUAG //AUAUUU/-PB
/—A1c—-/——–A3c———- //—Bc—–/
El SBARNi hace un reconocimiento por complementariedad de bases en el comando inteligente del Or2.
Esto permite un ensamble entre el sistema biológico ARNi y el RI=ADN-H primario A inteligente.
Veamos lo de una manera mas gráfica:
Este mecanismo genético se produce en la ETAPA EMBRIOGENICA.
El ordenador no ejecutable 2 se presenta in-habilitado.
El comando inteligente del Or2 anclado con la histona A genera el RI=ADN-H primario A inteligente el cual al ensamblarse en el paso 1 con la PROTEÍNA EMBRIOGENICA E: PE genera ciertos cambios en la susceptibilidad del receptor.
El ordenador que codifica la PE se encuentra en el CBSDC.
Esta PE convierte al receptor en NO REGULABLE, aumentando la afinidad de este por la Proteína A1 del SBARNi y por el otro ejerciendo una mayor exposición a la red química de la secuencia de bases de A3 para aumentar la efectividad del ensamble por complementariedad con la secuencia A3c del SBARNi.
La PA1 y la PB se unen al ARNi en el proceso de splicing generándole al nuevo sistema Biológico gran estabilidad en la red química.
En el paso 2 la secuencia A1c del SBARNi se une por complementariedad a la secuencia A1 del Or2 ayudado por la PA1 y la PE.
A continuación se unirán progresivamente la secuencia A3c del SBARNi con la secuencia A3 del Or2 si existe CORRESPONDENCIA entre ambas.
Una vez finalizado el proceso el Or2 ha sido RECONOCIDO por el SBARNi.
Este reconocimiento permite que la PB accione generando el paso 3 del mecanismo genético.
En el paso 3 la PB se ensamblara con el SISTEMA BIOLÓGICO DE RIBOTRANSFERENCIA INTERFERENTE ACTIVANTE. SBRIA.
EL SBRIA estará formado por un grupo de proteínas entre las que debe existir una TELOMERASA.
Terminada esta secuencia de ensambles de 3 pasos habrá que esperar el MECANISMO GENÉTICO DE DUPLICACIÓN DE ADN con el cual se concretara la orden generada por Or1 que produjo el ARNi en cuestión.
¿Como es activado el Or2 in-habilitado?
El ensamble anterior se mantendrá hasta que el Mecanismo de Duplicación del ADN alcance el punto A3E2.
Cuando la Topoisomerasa se acerque al punto A3E2 de la hebra adelantada choca con el SBRIA, rompe el punto A3E2 y el SBRIA aprovecha en meter la secuencia B.
El SBRIA al poseer actividad Telomerasa hace una transcripción inversa de la secuencia de Bc del SBARNi la cual invierte y la pega al extremo A3 a través de una Ligasa. El otro extremo de B lo pega a E2.
La ADNp que viene replicando la hebra adelantada cuando llega al punto A3B genera la secuencia de B complementaria y prosigue con la replicacion de E2.
Ahora la secuencia de B quedo incorporada en el Or2 y estabilizada por su secuencia complementaria en la hebra hija del Or2.
El ensamble entre el SBARNi y el SBRIA cumplió la orden y se desprende.
CONCLUSIÓN: del proceso de división celular obtuvimos 2 células hijas.
Célula 1: el Or2 fue activado agregando al comando inteligente el comando de transcripción.
Ahora dicho comando estará expuesto o no al Sistema Biológico Transcripcional según las necesidades de la célula 1. De estar expuesto la zona ejecutoria del ordenador se transcribirá generando una orden que es volcada a la red química.
Célula 2: donde el Or2 sigue in-habilitado.
A TRAVÉS DEL MECANISMO GENÉTICO DE RIBOTRANSFERENCIA INTERFERENTE ACTIVANTE Y EL DE DIVISIÓN CELULAR SE CONSIGUIÓ DIFERENCIAR LAS DOS CÉLULAS HIJAS.
Después de la duplicación del ADN las dos nuevas doble hélices hijas generadas son atacadas por el SISTEMA BIOLÓGICO DE CROMATIZACION.
Este ira metiendo las histonas para formar en cada doble hélice la nueva secuencia de nucleosomas del nuevo cromosoma.
En la doble hélice hija donde el Or2 se activo la HISTONA A SERA CAMBIADA POR LA HISTONA AB.
Esta se ensamblara ahora no solo con el comando inteligente del Or2 sino también con el comando transcripcional formando ahora lo que llamaremos: RI=ADN-H primario AB doble
Este nuevo receptor intranuclear estará formado por dos comandos:
-Comando inteligente: formado por la secuencia A1-A3 mas la histona AB.
-Comando transcripcional formado por la secuencia B y la histona AB.
Dentro de la Etapa Embriogenica existirá la PROTEÍNA EMBRIOGENICA E1- PE1 que tendrá gran afinidad por el comando inteligente del RI=ADN-H primario AB doble.
Esta PE1 al ensamblarse con el comando generara una mayor afinidad por la PA1 del SBARNi y aumentara las exposición a la red química de la secuencia de bases A3 para incrementar la posibilidad de ensamble por complementariedad de la secuencia A3c del SBARNi en cuestión.
Por otro lado el COMANDO TRANSCRIPCIONAL permanecerá expuesto continuamente a la red química y con una gran afinidad por el FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN INICIADOR ETAPA EMBRIOGENICA el cual dará inicio rápidamente a la secuencia del SISTEMA BIOLÓGICO TRANSCRIPCIONAL ETAPA EMBRIOGENICA que transcribirá el ordenador en cuestión.
La velocidad de transcripción de este sistema Biológico es altísimo lo que posibilita en una unidad de tiempo multiplicar la orden y por consiguiente aumentar la eficacia en su ejecución.
Mientras el Or2 es transcrito por el SBTee podría ocurrir que un SBARNi se ensamble positiva-mente con el comando inteligente.
Esto permitirá el acceso del SISTEMA BIOLÓGICO DE ROBOTRANSFERENCIA INTERFERENTE IN-HABILITANTE. (SBRII).
El SBRII contara entre otras proteínas, con la PROTEÍNA INHIBITORIA (PI).
Solo cuando la PI se una al SBRII se detendrá automáticamente la transcripción.
Ahora sera cuestión de esperar el mecanismo de duplicación de ADN para que se produzca la ejecución de la orden que en este caso sera la de in-habilitar nuevamente el Or2.
¿Como es in-habilitado el Or2?
La PI es fundamental en el SBRII. Esta es la ultima en ensamblarse al SBRII y la encargada de frenar automáticamente la transcripción del Or2. Mientras no se una la PI al SBRII el Or2 seguirá transcribiéndose.
El ordenador que codifica esta proteína , en nuestro modelo, esta ubicado en el CBSDC, es una proteína de la etapa embriogenica y fundamental en el mecanismo de in-habilitación de los ordenadores del CBM.
El ordenador que codifica la PE1 también se encuentra en el CBSDC.
Aparte de las funciones nombradas anteriormente la PE1 tras la duplicación del ADN, cuando las dos células hijas vuelven a tener el Or2 in-habilitado, se une en el mecanismo de cromatizacion al RI=ADN-H primario A inteligente, generando transitoriamente con la histona A y la PI un COMPLEJO PROTEICO IN-HABILITANTE DEL Or2.
Este tiene como función impedir que el Or2 vuelva a activarse mientras dure la etapa embriogenica.
Es importante entender lo siguiente:
Cuando hablamos de histona A e histona AB, no estamos hablando de una histona en particular sino de un
PATRÓN DE RECONOCIMIENTO generado por una o mas histonas pertenecientes al octamero de histonas.
El mecanismo de in-habilitación del Or2 se produce cuando la Topoisomerasa alcanza el punto A3B y en un accionar conjunto con el SBRII+PI eliminan de la doble hélice las secuencia de B y Bc en el Ordenador Biológico 2.
Ahora las dos células hijas tendrán el Or2 In-habilitado.
CONCLUSIÓN: el mecanismo de activación post inhibición en un mecanismo secuenciado.
EJEMPLO 1:
1- un ordenador no ejecutable del CBM in-habilitado es activado.
La activación se da en dos generaciones de células:
-Primera: se forma el COMPLEJO DE ACTIVACIÓN: Ordenador in-habilitado +SBARNi + SBRIA = CÉLULA MADRE 1.
– Segunda: tras la división celular:
CÉLULA HIJA 1: ORDENADOR NO EJECUTABLE activado.
CÉLULA HIJA 2: ORDENADOR NO EJECUTABLE in-habilitado
2- tras ser activado luego es in-habilitado.
la in-habilitación se da en dos generaciones de células:
-Primara: CÉLULA HIJA 1: se forma EL COMPLEJO DE IN-HABILITACIÓN: ordenador activado + SBARNi + SBRII+PI
-Segunda: tras la división celular:
CÉLULA HIJA 1 A: ORDENADOR NO EJECUTABLE inhabilitado.
CÉLULA HIJA 1 B: ORDENADOR NO EJECUTABLE inhabilitado.
3- al se in-habilitado no puede volver a ser activado.(Complejo Proteico In-habilitante)
En esta secuencia de divisiones celulares hubo una activación y una in-habilitación de un ordenador no ejecutable pero sin embargo ninguna de la tres células: CH2, CH1A y CH1B han cambiado su operatividad.
Se define una FASE en una secuencia de divisiones celulares al clon de células generadas que presentan la misma operatividad.
EJEMPLO 2:
Supongamos ahora el siguiente Ordenador ejecutable in-habilitado:
/–secuencia de fase–/–secuencia de procedencia o linea—-//– secuencia no gen–/–secuencia gen-/
/—————zona regulatoria ———————————–//—zona ejecutoria———————–/
En un punto de la secuencia el CBM activa un ordenador no ejecutable que posee en su zona ejecutoria no gen una secuencia de bases que reconoce un ordenador ejecutable. (SROE)
/—–A1—–/———–A3———–//—-B—–/———-SROE————–/
Esta SROE se corresponde con la zona regulatoria del ordenador ejecutable anterior. Es decir:
SROE = /—secuencia de procedencia o linea—/–secuencia de fase–/
El ordenador no ejecutable al ser transcripto genera el siguiente ARNi:
ARNi = //—Bc—-/—(secuencia de procedencia o linea)c–/—(secuencia de fase)c—/
En la red química este ARNi es madurado a través de ciertas proteínas que lo convierten en el respectivo SBARNi:
Este SBARNi se ensambla al ordenador ejecutable anterior, luego procede el SBRIA y tras la división celular una de las dos células hijas habrá activado el ordenador ejecutable adquiriendo una operatividad distinta a la célula madre.
Esta célula hija que vario su operatividad en relación a la célula madre define una linea.
Se define una LINEA en una secuencia de divisiones celulares al clon de células generadas que presentan una operatividad en común pero distinta a la de la célula que las origino. Es decir este clon de células habrá activado uno o mas ordenadores ejecutables o de diferenciación celular.
LEY GENÉTICA: TODO MECANISMO DE ACTIVACIÓN O IN-HABILITACIÓN DE ORDENADORES NO EJECUTABLES NECESITA 2 GENERACIONES DE CÉLULAS PARA EJECUTAR LA ORDEN.
EN LA PRIMERA GENERACIÓN SE FORMAN LOS ENSAMBLES CORRESPONDIENTES SEGÚN SEA ACTIVACIÓN O IN-HABILITACIÓN.
EN LA SEGUNDA GENERACIÓN LAS CÉLULAS HIJAS HABRÁN EFECTIVIZADO LAS ORDENES GRACIAS AL MECANISMO DE DUPLICACIÓN DEL ADN.
DEPENDIENDO EN QUE HEBRA ESTE EL ORDENADOR LAS ORDENES ACTIVANTES ESTARÁN EL LA CÉLULA HIJA 1 O 2 .
UN ORDENADOR NO EJECUTABLE SOLO PUEDE ACTIVAR UN ORDENADOR EJECUTABLE O DE DIFERENCIACIÓN CELULAR.
ES DECIR LOS ORDENADORES DE DIFERENCIACIÓN CELULAR SON TERMINALES, AL SER ACTIVADOS LA SITUACIÓN NUNCA MAS PUEDE SER ALTERADA.
Definamos la siguiente nomenclatura:
CÉLULA 1: célula 1
CBM1H1 = CBM1—B—CBM2—G1
OE1H2 = SROE1–ZONA EJECUTORIA
CBM1H1: ordenador no ejecutable 1 ubicado en la hebra 1
OE1H2: ordenador ejecutable 1 ubicado en la hebra 2.
CBM1: secuencia de reconocimiento del ordenador no ejecutable 1.
B: ordenador activado
CBM2: secuencia no gen (ARNi) del ordenador no ejecutable 1
SROE1: secuencia de reconocimiento del ordenador ejecutable ubicado en la hebra 2.
//: ordenador in-habilitado.
EJEMPLO 1
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CÉLULA 1
ORDENADORES ACTIVOS: ORDENADORES RECONOCEN ARNi
A CBM1H1 = CBM1—B–CBM2H1 A: CBM2H1 = CBM2–//–ZE
B CBM1H1 = CBM1—B–CBM3H2 CBM3H2 = CBM3–//–ZE
C CBM1H1 = CBM1—B–SROE1H2 OE1H2 = SROE1-//-ZE
D CBM1H1 = CBM1—B–CBM1H1 I: A,B,C,D
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A: ordenes de activación I: ordenes de in-habilitación ZE: zona ejecutoria
CÉLULA HIJA 1 CÉLULA HIJA 2
CBM2H1 = CBM2–B–ZE CBM3H2 = CBM3–B–ZE
OE1H2 = SROE1-B-ZE
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Analizamos el ejemplo 1:
El CBM1 esta formado por 4 ordenadores no ejecutables del los cuales el C activa uno o varios ordenadores ejecutables 1 que están en la hebra 2.
El A y B activan uno o varios ordenadores no ejecutables del CBM2 en la hebra 1 y CBM3 en la hebra 2.
La célula hija 1 tiene la misma operatividad que la célula 1 sin embargo la célula hija 2 cambio rotundamente la operatividad generando una linea.
El ordenador no ejecutable D del CBM1 es AUTO VINCULANTE.
Auto Vinculante significa que la secuencia de bases no gen de la zona ejecutoria reconoce vía ARNi al comando inteligente de los ordenadores pertenecientes al mismo CBM1.
Este ordenador no ejecutable auto vinculante podría tener en la zona ejecutoria no gen varias secuencias generadoras de ARNi. Por ejemplo:
D CBM1H1 = CBM1—B—CBM1–CBM1–CBM1–CBM1
¿ Como pueden los ordenadores del CBM1 generar activaciones antes de ser in-habilitados en la fase G1 del ciclo celular sin fallar?
La evolución pudo superar este conflicto a través del CBSDC y el SBT etapa embriogenica.
Con el CBSDC modula el tiempo de la fase G1 y con el SBTee aumenta la transcripción de los ordenadores activos aumentando el numero de los ARNi .
Tras la división celular, cuando comienza la Fase G1 de la Célula 1, los ordenadores del CBM1 al estar activos son atacados inmediatamente por el SBTee el cual comienza la transcripción generando cantidades de ARNi.
Estos generan tanto los ensambles activantes como los in-habilitantes.
Sin embargo, los in-habilitantes siguen generando la transcripción del ordenador hasta tanto se una al SBRII la PROTEÍNA I (PI).
Al ser sintetizada por el CBSDC, este comenzara la transcripción del ordenador de la PI ya casi llegando al final de la Fase G1, en el tiempo mas cercano posible al comienzo de la duplicación del ADN.
Con esta secuencias de hechos en la fase G1 y gracias al CBSDC la evolución se aseguro que en la etapa embriogenica todas las ordenes que deberían ser ejecutadas se ejecuten sin posibilidad de fallar.
A esto debemos agregar el hecho de que en cada punto de la secuencia las ordenes están por duplicado, la materna y la paterna.
EJEMPLO 2
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CÉLULA HIJA 1
ORDENADORES ACTIVOS ORDENADORES RECONOCEN ARNi
A CBM2H1 = CBM2–B–CBM3H2 A: CBM4H1 = CBM4–//–ZE
B CBM2H1 = CBM2–B–SROE1H2 CBM3H2 = CBM3–//—ZE
C CBM2H1 = CBM2–B–CBM4H1 SROE1H2 = SROE1-//–ZE
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CÉLULA HIJA 1-1 CÉLULA HIJA 1-2
CBM4H1 = CBM4–B—ZE CBM3H2 = CBM3–B–ZE
CBM2H1 = CBM2–B–CBM3H2 SROE1H2 = SROE1-B-ZE CBM2H1 = CBM2–B–SROE1H2
CBM2H1 = CBM2–B–CBM4H1
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EJEMPLO 3
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CÉLULA HIJA 1-1
ORDENADORES ACTIVOS ORDENADORES RECONOCEN ARNi
A CBM2H1 = CBM2–B–CBM3H2 A: CBM5H1 = CBM5–//–ZE
B CBM2H1 = CBM2–B–SROE1H2 CBM3H2 = CBM3–//–ZE
C CBM2H1 = CBM2–B–CBM4H1 SROE1H2 = SROE1-//-ZE
D CBM4H1 = CBM4–B–CBM2H2 I: A,B,C,D,E.
E CBM4H1 = CBM4–B–CBM5H1
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CÉLULA HIJA 1-1-1 CÉLULA HIJA 1-2-2
CBM5H1 = CBM5–B–ZE CBM3H2 = CBM3–B–ZE
SROE1H2 = SROE1-B-ZE
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Los ordenadores del Genoma Humano fueron concebidos en la red química, empaquetados en el ADN y luego enrollados en el cable proteico para formar los cromosomas.
Pensemos lo siguiente: en el cuerpo humano los distintos clones diferenciadas se agrupan formando órganos. Estos son independientes, sin embargo a través de la sangre se comunican usando un LENGUAJE por medio de MOLÉCULAS ORGÁNICAS que le permiten trabajar armónicamente en post de la MASA PLURICELULAR TOTAL.
Lo mismo ocurriría en el núcleo de las células; los ordenadores estarían agrupados de manera independiente utilizando un LENGUAJE de comunicación entre ellos a través de MOLÉCULAS ORGÁNICAS.
A grandes rasgos en nuestro modelo nos interesan los siguientes grupos:
CBM: este grupo esta formado por todos los ordenadores no ejecutables in-habilitados pertenecientes al sistema operativo que posibilitan el mecanismo de diferenciación celular.
ORDENADORES EJECUTABLES DE DIFERENCIACIÓN CELULAR: este grupo esta formado por todos los ordenadores ejecutables in-habilitados que son activados progresivamente en la secuencia de la vida por el CBM.
GRUPO ADN: este grupo esta formado por todos los ordenadores que intervienen en el proceso de duplicación del ADN.
Para que se produzca la duplicación del ADN es necesario en un principio de cuatro grupos de ordenadores con funciones especificas:
-Grupo 1 duplicación ADN: formado por todos los ordenadores encargados de sintetizar todas las proteínas e histonas estructurales necesarias en el Proceso de Cromatizacion post duplicación ADN.
– Grupo 2 duplicación ADN: formado por todos los ordenadores encargados de sintetizar las proteínas y enzimas encargadas tras la duplicación del ADN de introducir en las dos doble hélice hijas las histonas necesarias para formar la secuencia de nucleosomas que darán lugar a los nuevos cromosomas.
A este sistema biológico lo denominaremos: SB de CROMATIZACION.
– Grupo 3 duplicación ADN: formado por los ordenadores encargados de sintetizar las proteínas y enzimas
que forman parte del Sistema Biológico de Duplicación ADN (SBD-ADN).
– Grupo 4 iniciador duplicación ADN: ordenador encargado de sintetizar la PROTEÍNA R (PR). Esta proteína seria la encargada de reconocer y romper la secuencia de bases interlocus R posibilitando el ensamble secuenciado de las proteínas y enzimas del grupo 3 hasta formar el replisoma el cual da inicio a la duplicación.
Este GRUPO ADN de ordenadores es el que en la CÉLULA BASE permitía la duplicación sin ningún tipo de sincronizacion, simplemente se producía.
SBT: este grupo esta formado por todos los ordenadores encargados de sintetizar las proteínas y enzimas del Sistema Biológico Transcripcional.
Estaría formado por:
-Factores de Transcripción
– ARN polimerasas.
Los factores de transcripción son un grupo de proteínas encargadas de reconocer el comando transcripcional B (Promotor) expuesto a la red química preparando espacialmente el terreno para facilitar el ingreso y accionar de las ARN polimerasas. Estos Factores de transcripción actuaran también a lo largo de toda la ruta re-acondicionando-la a medida que avanza la ARNp.
En la CÉLULA BASE se genero un SBT basal el cual debió ser mejorado por la evolución para cumplir eficazmente con ciertas situaciones. Una de ellas es la etapa embriogenica.
Los ordenadores ejecutables permanentemente activos que componen el grupo tienen un comando transcripcional REGULABLE.
El modelo plantea que son AUTO-REGULABLES, es decir, cuando en la red química disminuye la concentración de algún factor estos ordenadores expondrán los comando de transcripción a la red química para ser transcrito por el SBT.
Entonces: el SBT transcribe ordenadores que sintetizan SBT cuando en la red química disminuye la concentración de alguno de sus integrantes.
Por otro lado es muy probable que estos factores sean muy resistentes a la acción catalítica.
Para la etapa embriogenica, la evolución creo un grupo de ordenadores que ubico en el CBSDC y que sintetizan lo que llamaremos: FTR: factores de transcripción regula-torios.
La función de los FTR es la de integrarse al SBT basal para convertirlo en SBTee.
Estos FTR se irán ensamblando en la secuencia de la transcripción a los demás factores según corresponda generando una mayor velocidad de transcripción por parte de la ARNp y por consiguiente generara una mayor cantidad de moléculas de ARNm inmaduro en una unidad de tiempo que el SBT basal en esa misma unidad.
CBSDC: formado por un grupo de ordenadores no ejecutables in-habilitados (es decir las ordenes que portan tienen efecto a nivel de ordenadores)
Todos los ordenadores que lo componen están in-habilitados y dependen del CBM para su activación.
Estos ordenadores lo podemos dividir en dos sub-grupos:
-CBSDC-EE: cluster biológico sincroniza la división celular etapa embriogenica: en esta etapa servirá de nexo entre el CBM y el GRUPO ADN.
Su función sera la de darle al CBM las herramientas que le permitan incrementar en un 100 % la eficacia en la ejecución de las ordenes generadas por el.
¿Que tipo de proteínas sintetizan los ordenadores del CBSDC-EE?
En nuestro modelo las denominaremos: PROTEÍNAS REGULADORAS CBSDC-EE
Existen dos grandes grupos con objetivos diferentes:
1- las que actúan sobre el sistema biológico nucleosoma exponiendo a la red química los diferentes comando para que actúen sobre estos los respectivos sistemas biológicos.
En este caso las llamaremos :
PER: proteínas embriogenicas regulatorias
2- actúan sobre los SBT aumentando la velocidad de la transcripción.
FTR: factores de transcripción regulatorios
¿Como estarán formados estos ordenadores?
Supongamos un ordenador no ejecutable del CBSDC-EE y que esta activo:
/———————zona regulatoria—————/———zona ejecutoria————-/
/—A1—/——————-A2———//—-B—–/———zona ejecutoria————-/
El modelo plantea que existen dos tipos de Histonas:
-Histonas Inteligentes: son aquellas histonas que tienen áreas en la estructura espacial proteica que anclan
con ciertas secuencias de bases especificas de la doble hélice generando los receptores intranucleares ADN-histona. Dicho de otra manera: una secuencia de bases X meterá en el mecanismo de Cromatizacion una histona inteligente X la cual tendrá un área tridimensional de amino-ácidos en su estructura espacial que anclara con dicha secuencia de bases.
Si por algún motivo esa secuencia de bases X cambia por una secuencia Y, ahora la histona X dejara de tener afinidad por la secuencia de bases y sera reemplazada por otra histona inteligente que si tenga afinidad.
-Histonas Estructurales: son las histonas que estructuran espacialmente los octameros de histonas anclándose a las histonas inteligentes.
Estas histonas estructurales anclarían con la doble hélice a través de los grupos fosfatos de la misma.
Por otro lado ciertos estímulos químicos en los lugares secundarios podrían alterar la estructura global del nucleosoma generando una mayor o menor exposición a la red química del lugar principal.
Volvamos al ordenador que estábamos analizando anteriormente:
Zona regulatoria = A + B
A: secuencia de bases de reconocimiento del ordenador.
B: secuencia de bases de activación del ordenador.
A = A1 + A2
A1: secuencia de re-conocimiento de especie
A2: secuencia de reconocimiento de cluster = A2C + A2H
A2: /————A2C—————–/—A2H—-//
Cuales serian las secuencias de reconocimiento de histonas en el lugar principal:
A1: secuencia de reconocimiento de histona
A2H + B: secuencia de reconocimiento de histona.
LEY GENÉTICA: TODOS LOS CLUSTER BIOLÓGICOS QUE FORMAN PARTE DEL CBM POSEEN DISTINTAS SECUENCIAS DE BASES EN A2C PERO SIEMPRE LA MISMA SECUENCIA DE BASES EN A2H.
El comando inteligente o transcripcional de todos los ordenadores del CBM son no regulables, es decir siempre están expuestos a la red química permitiendo el acceso al sistema biológico que corresponda.
Esto es debido a que las secuencias de A1 y A2H + B se unen a histonas inteligentes que permiten junto a ciertas proteínas embriogenicas reguladoras la exposición continua de los comandos a la red química.
En el caso del CBSDC-EE, no todos los ordenadores que lo componen poseerán en la secuencia de bases A2 la secuencia A2H.
Entonces existirán dos tipos de ordenadores:
-Los ordenadores que poseen la secuencia A2H: estos al ser activados presentaran la secuencia A2H + B
que se unirá a la histona inteligente correspondiente. Esto permitirá que el comando transcripcional de estos ordenadores siempre este expuesto al SBTee.
Este seria el caso de las siguientes PROTEÍNAS REGULADORAS: PE, PE1, PB, PA1, FTR, entre otras.
– Los ordenadores que no poseen la secuencia A2H:
A = A1 + A2
A2: /————–A2C———–/—–A2Hx——/
Cuando el ordenador es activado, en el mecanismo de cromatizacion, las secuencia de bases A2Hx + B
reconocen una histona diferente a la que reconocía la secuencia A2H + B.
El comando de transcripción de este ordenador es ahora REGULABLE, la exposición o no del comando a la red química dependerá ahora de ciertas proteínas o enzimas.
Este seria el caso de la PI entre otras.
El hecho de que el ordenador de la PI sea regulable le permite al CBM tener el tiempo necesario para asegurar las ordenes activantes o in-habilitantes a través de los SBARNi y poder cuando lo desee exponer a la red química el comando de transcripción del ordenador de la PI para que así sea transcrita y sintetizada.
Por otro lado le permitiría al CBM adelantar o retrasar el mecanismo de duplicación del ADN dentro de la FASE G1:
– Adelantaría la duplicación del ADN si el CBM actúa directamente sobre el GRUPO ADN.
– Retrasaría la duplicación del ADN si el CBM actúa usando como intermediario al CBSDC y este sobre el GRUPO ADN.
Antes de proseguir definamos nuevos conceptos:
ORDENADORES VINCULANTES: son vinculantes cuando poseen en la zona ejecutoria una secuencia no gen que vía ARNi reconoce la zona regulatoria de otros ordenadores.
ORDENADORES NO VINCULANTES: son no vinculantes cuando no poseen en la zona ejecutoria una secuencia no gen que reconozca otro ordenador.
ORDENADORES AUTO VINCULANTES: son auto vinculantes cuando poseen en la zona ejecutoria una secuencia no gen que vía ARNi reconocen la zona regulatoria de los ordenadores del mismo cluster que genero el ARNi.
LEY GENÉTICA: LOS ORDENADORES QUE COMPONEN EL CBSDC-EE SON NO EJECUTABLES Y SON ACTIVADOS I/O IN-HABILITADOS POR EL CBM, SON NO VINCULANTES Y SI POSEEN EN LA ZONA EJECUTORIA LA SECUENCIA NO GEN, ESTA ES DE TIPO E2.
-CBSDC-PA: cluster biológico que sincroniza la división celular programa de aplicación:
Cuando finaliza la etapa embriogenica, todos los ordenadores del CBM y CBSDC-EE habrán sido in-habilitados; en este punto todas las células se habrán diferenciado y por ende adquirido el programa de aplicación que portaran hasta el final de la vida.
Sin embargo, cada clon diferenciado, antes de que la secuencia se cierre el CBM activara en cada uno de ellos según el clon un grupo de ordenadores que formaran el CBSDC-PA.
La función de este grupo de ordenadores agrupados en el CBSDC-PA sera la de permitir o no el acceso de la célula diferenciada a la división celular.
– Si permite el acceso es porque los ordenadores del CBSDC-PA están habilitados y la exposición o no de estos al SBT dependerá de estímulos extra-celulares sujetos a la operatividad de la célula en cuestión.
– Si no permite el acceso es porque la evolución determino que la operatividad especifica que logro para ese clon no funcionara si la célula accede a la división celular.
Estos diferentes CBSDC-PA estarían compuestos por ordenadores no ejecutables in-habilitados que son activados en la secuencia por el CBM y pasaran a formar parte de los distintos programas de aplicación
de las células diferenciadas que portaran hasta el final de la vida.
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PATRONES DE RECONOCIMIENTO GENERADOS POR LAS SECUENCIAS DE BASES NITROGENADAS EN LA DOBLE HÉLICE.
Ciertas Secuencias de bases nitrogenadas que forman las dos cadenas complementarias del ADN generan patrones de reconocimiento que son reconocidos por diferentes efectores.
En primera instancia, ciertas secuencias reconocen ciertas áreas de las histonas inteligentes generando lo que llamamos RI=ADN-H.
Estos receptores intranucleares generan puertas y ventanas sobre el Sistema biológico nucleosoma que al estar expuestos a la red química son reconocidos por diferentes sistemas biológicos transitorios, como el SBT o el SBD-ADN entre otros.
Por otro lado, la transcripción genera ARNm inmaduro el cual es sometido al mecanismo de Splicing generando una o varias moléculas de ARNm maduro.
Las diferentes proteínas y enzimas que intervienen en el mecanismo de splicing actúan reconociendo ciertas secuencias de bases o codones del ARNm inmaduro.
El ARN de transferencia reconoce un codon del ARNm maduro con el cual comienza la síntesis de la cadena polipeptidica y otro codon especifico sera el encargado de detener la síntesis. Luego cada amino-ácido que es metido en la cadena polipeptidica depende de un codon especifico que reconoce el ARNt.
Ley genética: los ordenadores del genoma humano son los que codifican la información genética sin embargo la funcionalidad operativa para levantar la orden y ejecutarla en el momento justo es lograda gracias a los innumerables sistemas biológicos creados por la evolución que accionan cuando están en la red química y reconocen un patrón de reconocimiento especifico.
Este accionar produce una secuencia de hechos que se vinculan con otras secuencias a través de procesos regulatorios. Estos procesos regulatorios deberán poner en la red química el sistema biológico cuando lo necesite la célula y exponer en simultaneo el patrón de reconocimiento.
Esto jamas se detiene y pasa de un punto a otro gracias al juego entre patrones de reconocimiento y efectores. Estos son creados por la evolución a través de combinaciones espontaneas entre moléculas gracias al metabolismo concebido en la célula base que proporciona energía a través de mediadores químicos.
Por otro lado la evolución debió ordenar la información genética contenida en los programas de aplicación que eran gestados por las crecientes células del CCES de las masas pluricelulares creando una secuencia a través de un sistema operativo que levante la orden y la ejecute en el momento justo de vida biológica de la masa. Este SO en un momento se cerrara y dejara librada la continuidad de vida de la masa a los programas de aplicación y su vinculación entre ellos.
Estos por si solos con el tiempo y en su relación con el medio ambiente no tienen otra posibilidad que la de ir claudicando paulatinamente por diversos factores terminando inminente-mente en una falla que no puede superar la masa pluricelular produciendo la muerte de la misma.
El ENVEJECIMIENTO NO ES PRODUCIDO POR UN MECANISMO GENÉTICO, es producto de una falla paulatina de los programas de aplicación en su relación con el medio ambiente.
Todo comenzó con la CÉLULA BASE pero los diferentes programas de aplicación que fueron gestados por el CCES y estructurados por el CCER y la CR a través del Sistema operativo o CBM junto a los innumerables sistemas biológicos que hicieron funcional el proceso delimitaron diferentes CAMINOS EVOLUTIVOS GENÉTICOS que dieron origen a las DISTINTAS ESPECIES.
No todos los Caminos Evolutivos Genéticos resolvieron los interrogantes de LA NECESIDAD DE de la misma manera por consiguiente en cada caso el CCER y la CR debieron crear un sistema operativo diferente acorde a los diferentes programas de aplicación provenientes del CCES.
Muchos por diversos factores no prosperaron y claudicaron, otros se estancaron en algún punto y otros aun hoy siguen evolucionando gracias a la versatilidad de los programas de aplicación.
Los conflictos genéticos no siempre son superados y la especie puede desaparecer.
Cuando hablamos de LA NECESIDAD DE nos referimos a:
La necesidad de: protegerse del medio ambiente
La necesidad de: conseguir alimento del medio ambiente.
La necesidad de: permanecer en el tiempo y reproducirse.
La necesidad de: eliminar los desechos del metabolismo celular; etc, etc, etc.
esta teoría continua ya que hay muchísimas cuestiones que debo tratar.
Autor:
Oscar Horacio Croatto
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