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Programación Paralela con Memoria Compartida (página 2)

Enviado por Pablo Turmero


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Secciones omp #pragma omp section Precede cada bloque de código dentro del bloque abarcado descrito anteriormente Puede ser omitido por la primera sección paralela después del pragma parallel sections Los segmentos de programa adjuntos se distribuyen para ejecución paralela entre hilos disponibles

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Paralelismo a nivel funcional con secciones #pragma omp parallel sections { #pragma omp section /* Optional */ a = alice(); #pragma omp section b = bob(); #pragma omp section c = cy(); }

s = boss(a, b); printf ("%6.2fn", bigboss(s,c));

(Gp:)

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Ventajas de las secciones paralelas Secciones independientes de código se pueden ejecutar concurrentemente

Serial Paralela #pragma omp parallel sections { #pragma omp section phase1(); #pragma omp section phase2(); #pragma omp section phase3(); }

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Nuevo Soporte de OpenMP Tareas – Lo principal en OpenMP 3.0 Permite paralelización de problemas irregulares Ciclos sin límite Algoritmos recursivos Productor/Consumidor

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¿Qué son las tareas? Las tareas son unidades de trabajo independientes Los hilos se asignan para ejecutar trabajo en cada tarea Las tareas pueden diferirse Las tareas pueden ejecutarse inmediatamente El sistema en tiempo de ejecución decide cual de las descritas anteriormente Las tareas se componen de: código para ejecutar Ambiente de datos Variables de control internas (ICV) Serial Paralelo

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Ejemplo de task Se crea un grupo de 8 hilos #pragma omp parallel // assume 8 threads { #pragma omp single private(p) { … while (p) { #pragma omp task { processwork(p); } p = p->next; } } } Un hilo tiene acceso a ejecutar el ciclo while El hilo que ejecuta el “ciclo while” crea una tarea por cada instancia de processwork()

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Task – Visión explícita de una tarea Se crea un equipo de hilos en el omp parallel Un solo hilo se selecciona para ejecutar el ciclo while – a este hilo le llamaremos “L” El hilo L opera el ciclo while, crea tareas, y obtiene el siguiente apuntador Cada vez que L pasa el omp task genera una nueva tarea que tiene un hilo asignada Cada tarea se ejecuta en su propio hilo Todas las tareas se terminan en la barrera al final de la región paralela

#pragma omp parallel { #pragma omp single { // block 1 node * p = head; while (p) { //block 2 #pragma omp task private(p) process(p); p = p->next; //block 3 } } }

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¿Qué tareas son útiles? #pragma omp parallel { #pragma omp single { // block 1 node * p = head; while (p) { //block 2 #pragma omp task process(p); p = p->next; //block 3 } } }

Tienen potencial para paralelizar patrones irregulares y llamadas a funciones recursivas (Gp:) Bloque 1 (Gp:) Bloque 2tarea 1 (Gp:) Bloque 2tarea 2 (Gp:) Bloque 2tarea 3 (Gp:) Bloque 3 (Gp:) Bloque3 (Gp:) Tiempo (Gp:) Un solo hilo

(Gp:) Bloque 1 (Gp:) Bloque 3 (Gp:) Bloque 3 (Gp:) Hilo1 Hilo2 Hilo3 Hilo4 (Gp:) Bloque 2tarea 2 (Gp:) Bloque2tarea 1 (Gp:) Bloque2tarea 3 (Gp:) Tiempo ahorrado

(Gp:) Espera (Gp:) Espera

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Actividad 3 – Lista encadenada usando tareas Objetivo: Modifica la lista encadenada para implementar tareas para paralelizar la aplicación Sigue la lista encadenada de tareas llamada LinkedListTask en el documento de la práctica

while(p != NULL){ do_work(p->data); p = p->next; }

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¿Cuándo las tareas se garantizan a ser completadas? Las tareas se garantizan a ser completadas: En las barreras de los hilos o tareas En la directiva: #pragma omp barrier En la directiva : #pragma omp taskwait

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Ejemplo de terminación de tareas #pragma omp parallel { #pragma omp task foo(); #pragma omp barrier #pragma omp single { #pragma omp task bar(); } } Aquí se crean varias tareas foo – una para cada hilo Se garantiza que todas las tareas foo terminan aquí Aquí se crea una tarea bar Se garantiza que la tarea bar termina aquí

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Alcance de los datos – ¿Qué se comparte? OpenMP usa un modelo de memoria compartida Variable compartida – una variable que pueden leer o escribir varios hilos La cláusula shared puede usarse para hacer elementos explícitamente compartidos Las variables globales se comparten por default entre tareas Variables globales, variables con alcance del namespace, variables estáticas, variables con calificador de constante que no tienen miembro mutable son compartidas, Variables estáticas que son declaradas en un alcance dentro del bloque de construcción son compartidas

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Alcance de los datos – ¿Qué es privado? No todo se comparte… Ejemplos de determinadas variables implícitamente privadas: Las variables locales (stack) en funciones llamadas de regiones paralelas son PRIVADAS Las variables automáticas dentro de un bloque de sentencias de omp son PRIVADAS Las variables de iteración de ciclos son privadas Las variables implícitamente declaradas privadas dentro de tareas serán tratadas como firstprivate

La cláusula Firstprivate declara uno o más elementos a ser privados para una tarea, y inicializa cada uno de ellos con un valor

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Un ejemplo de ambiente de datos (Gp:) temp (Gp:) A, index, count (Gp:) temp (Gp:) temp (Gp:) A, index, count

¿Cuáles variables son compartidas y cuáles privadas? float A[10]; main () { integer index[10]; #pragma omp parallel { Work (index); } printf (“%dn”, index[1]); } extern float A[10]; void Work (int *index) { float temp[10]; static integer count; <…> } A, índex, y count se comparten en todos los hilos, pero temp es local para cada hilo

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int fib ( int n ) {

int x,y; if ( n < 2 ) return n; #pragma omp task x = fib(n-1); #pragma omp task y = fib(n-2); #pragma omp taskwait return x+y } Problema con el Alcance de los datos – ejemplo de fib n es privada en ambas tareas ¿Qué es incorrecto? No se pueden usar variables privadas fuera de las tareas x es una variable privaday es una variable privada

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int fib ( int n ) {

int x,y; if ( n < 2 ) return n; #pragma omp task shared(x) x = fib(n-1); #pragma omp task shared(y) y = fib(n-2); #pragma omp taskwait return x+y; }

n es privada en ambas tareas x & y son compartidas Buena solución necesitamos ambos valores para calcular sum Ejemplo del alcance de datos – ejemplo de fib

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List ml; //my_list Element *e; #pragma omp parallel #pragma omp single { for(e=ml->first;e;e=e->next) #pragma omp task process(e); } Problema con el alcance de datos – Recorrido de listas ¿Qué está mal aquí? Posible condición de concurso !La variable compartida e la actualizan múltiples tareas

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List ml; //my_list Element *e; #pragma omp parallel #pragma omp single { for(e=ml->first;e;e=e->next) #pragma omp task firstprivate(e) process(e); } Buena solución – e es firstprivate Ejemplo de alcance de datos – Recorrido de listas

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List ml; //my_list Element *e; #pragma omp parallel #pragma omp single private(e) { for(e=ml->first;e;e=e->next) #pragma omp task process(e); } Buena solución – e es privada Ejemplo de alcance de datos – Recorrido de listas

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List ml; //my_list #pragma omp parallel { Element *e; for(e=ml->first;e;e=e->next) #pragma omp task process(e); } Ejemplo de alcance de datos – Recorrido de listas Buena solución – e es privada

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Ejemplo: Producto Punto float dot_prod(float* a, float* b, int N) { float sum = 0.0; #pragma omp parallel for shared(sum) for(int i=0; i< num_steps; i++){ x = (i+0.5)*step; sum = sum + 4.0/(1.0 + x*x); } pi = step * sum; printf(“Pi = %fn”,pi); }

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C/C++ Operaciones de reducción Un rango de operadores asociativos y conmutativos pueden usarse con la reducción Los valores iniciales son aquellos que tienen sentido

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Actividad 4 – Calcular Pi Paraleliza el código de integración numérica usando OpenMP ¿Qué variables pueden compartirse? ¿Qué variables necesitan ser privadas? ¿Qué variables pueden usarse en reducciones? static long num_steps=100000; double step, pi;

void main() { int i; double x, sum = 0.0;

step = 1.0/(double) num_steps; for (i=0; i< num_steps; i++){ x = (i+0.5)*step; sum = sum + 4.0/(1.0 + x*x); } pi = step * sum; printf(“Pi = %fn”,pi); }

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Bloque de construcción Single Denota un bloque de código que será ejecutado por un solo hilo El hilo seleccionado es dependiente de la implementación Barrera implícita al final #pragma omp parallel { DoManyThings(); #pragma omp single { ExchangeBoundaries(); } // threads wait here for single DoManyMoreThings(); }

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Bloque de construcción Master Denota bloques de código que serán ejecutados solo por el hilo maestro No hay barrera implícita al final #pragma omp parallel { DoManyThings(); #pragma omp master { // if not master skip to next stmt ExchangeBoundaries(); } DoManyMoreThings(); }

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Barreras implícitas Varias sentencias de OpenMP* tienen barreras implícitas Parallel – barrera necesaria – no puede removerse for single Las barreras innecesarias afectan el rendimiento y pueden removerse con la cláusula nowait La cláusula nowait puede aplicarse a : La cláusula For La cláusula Single

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Cláusula Nowait Cuando los hilos esperarían entren cómputos independientes #pragma single nowait { […] }

#pragma omp for nowait for(…) {…}; #pragma omp for schedule(dynamic,1) nowait for(int i=0; i< n; i++) { #pragma omp atomic x[index[i]] += work1(i); y[i] += work2(i); }

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Bloque de Construcción Parallel – Vista de tareas explícita Las tareas se crean en OpenMP incluso sin una directiva task explícita Veremos como las tareas se crean implícitamente para el fragmento de código que está abajo. El hilo que encuentra la sentencia parallel empaca un conjunto de tareas implícitas Se crea un conjunto de hilos. Cada hilo en el equipo está asignado a una de las tareas (y vinculado a ella). La barrera mantiene el hilo maestro original hasta que todas las tareas implícitas terminan (Gp:) #pragma omp parallel

(Gp:) #pragma omp parallel { int mydata code }

{ int mydata; code… } (Gp:) { mydatacode }

(Gp:) { mydatacode } (Gp:) { mydatacode }

(Gp:) Thread (Gp:) 1 (Gp:) Thread (Gp:) 2 (Gp:) Thread (Gp:) 3

Barrier

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Bloque de construcción Task #pragma omp task [clause[[,]clause] …] bloque estructurado if (expresion) untied shared (lista) private (lista) firstprivate (lista) default( shared | none ) Donde la claúsula puede ser un:

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Tareas vinculadas y tareas no vinculadas Tareas vinculadas: Una tarea vinculada se le asigna un hilo en su primera ejecución y este mismo hilo le da servicio a la tarea por su tiempo de vida. Un hilo ejecutando una tarea vinculada, puede suspenderse, y enviarse a ejecutar otra tarea, pero eventualmente, el mismo hilo regresará a continuar la ejecución de su tarea vinculada originalmente. Las tareas están vinculadas mientras no se declare desvincular explícitamente

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Tareas vinculadas y tareas no vinculadas Tareas no vinculadas: Una tarea no vinculada no tienen ninguna asociación a largo plazo con ningún hilo. Cualquier hilo que no esté ocupado puede ejecutar una tarea no vinculada. El hilo asignado para ejecutar una tarea no vinculada solo puede cambiar en un “punto de planificación de tareas” Una tarea no vinculada se crea agregando “untied” a la cláusula tarea Ejemplo: #pragma omp task untied

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Cambio de tareas Cambio de tareas El acto de un hilo en cambiar de la ejecución de una tarea a otra tarea.

El propósito de cambiar la tarea es distribuir hilos a lo largo de las tareas no asignadas en el equipo para evitar que se acumulen colas largas de tareas no asignadas

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Cambio de tareas El cambio de tareas, para tareas vinculadas, solo puede ocurrir en puntos de planificación de tareas localizados dentro de los siguientes bloques de construcción Se encuentran sentencias task Se encuentran sentencias taskwait Se encuentran directivas barrier Regiones barrier implícitas Al final de una región de tarea vinculada

Las tareas no vinculadas tienen implementación dependiendo de los puntos de planificación

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