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Análisis de datos en bioinformática

Enviado por Pablo Turmero


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    Definiciones de Bioinformática ? La Bioinformática obtiene conocimiento a partir del análisis informático de los datos biológicos. La investigación en bioinformática incluye el desarrollo de metodologías para el almacenamiento, recuperación y análisis de los datos. (Institute Pasteur, France)? ? Bioinformática es la investigación, desarrollo o aplicación de herramientas informáticas para obtener, almacenar, organizar, archivar, analizar o visualizar datos biológicos. (National Institutes of Health, USA)? ? La Bioinformática es una integración de métodos matemáticos, estadísticos e informáticos para analizar datos biológicos, bioquímicos y biofísicos. (Georgia Institute of Technology, USA)? ? La Bioinformática es la ciencia y la tecnología para obtener, administrar y procesar la información biológica. (Missouri University, USA)?

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    Campos activos en Bioinformática ? creación, mantenimiento y explotación de bases de datos

    ? anotación de secuencias genómicas

    ? anotación funcional de genes

    ? predicción de estructura secundaria de proteínas

    ? análisis evolutivos

    ? análisis de expresión génica (microarrays)?

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    Campos activos en Bioinformática ? creación, mantenimiento y explotación de bases de datos

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    Campos activos en Bioinformática ? anotación de secuencias genómicas

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    Campos activos en Bioinformática ? anotación funcional de genes

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    Campos activos en Bioinformática ? predicción de estructura secundaria de proteínas

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    Campos activos en Bioinformática ? análisis evolutivos

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    Campos activos en Bioinformática ? análisis de expresión génica (microarrays)?

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    Campos activos en Bioinformática ? creación, mantenimiento y explotación de bases de datos

    ? anotación de secuencias genómicas

    ? anotación funcional de genes

    ? predicción de estructura secundaria de proteínas

    ? análisis evolutivos

    ? análisis de expresión génica (microarrays)?

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    Conceptos horizontales en Bioinformática ? Open Source (licencia GNU)?

    ? Lenguajes de programación (Perl, R, Java…)?

    ? Algoritmos (BLAST, Fasta,…)?

    ? Linux

    ? Bases de datos relacionales (SQL, XML)?

    ? Arquitectura clienteservidor (web-services)?

    ? Clusters de PC’s

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    Conceptos horizontales en Bioinformática ? Open Source (licencia GNU)?

    ? Lenguajes de programación (Perl, R, Java…)?

    ? Algoritmos (BLAST, Fasta,…)?

    ? Linux

    ? Bases de datos relacionales (SQL, XML)?

    ? Arquitectura cliente-servidor (web-services)?

    ? Clusters de PC’s

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    Movimiento Open Source Distribución libre del código fuente de los programas.

    Posibilidad de modificación y redistribución del software y su código fuente. – mayor número de programadores implicados – mayor número de usuarios poniendo a prueba el software – mayor tasa de mejora, adaptación y solución de errores en el código (bugs)? – creación de un software no opaco para el usuario http://www.opensource.org

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